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CELLO:基于H&E图像的单细胞空间转录组预测框架

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AI 综述

CELLO是一个端到端框架,通过单次病理基础模型前向传播与网格采样,从H&E染色病理图像中同时提取所有细胞的位置特异性特征,并引入距离衰减交叉注意力模块利用空间局部形态上下文细化细胞表征。在52对公共Xenium-H&E数据(约1000万细胞、12个器官)上,CELLO平均预测精度优于基线,整体推理时间较DeepSpot2Cell提速14倍(不含上游细胞分割)。

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报道时间线

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9月30日
  1. arXiv · Computer Vision
    CELLO:基于组织病理学图像的端到端单细胞空间转录组预测框架

    CELLO通过单次病理基础模型前向传播与网格采样,从H&E染色病理图像中同时提取所有细胞的位置特异性特征,并引入距离衰减交叉注意力模块利用空间局部形态上下文细化细胞表征。在52对公共Xenium-H&E数据(约1000万细胞、12个器官)上,CELLO平均预测精度优于基线,整体推理时间较DeepSpot2Cell提速14倍(不含上游细胞分割)。

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